在戰亂及政權交替中,日治時期官方及坊間刊行的各種出版品面臨了毀損與保存不易等問題。為深化臺灣史研究,中央研究院臺灣史研究所透過研究人員薦購與各界人士贈送,積極徵集1950年以前出版的舊籍。且基於提升日治舊籍使用率,改善圖書典藏品質,於民國88年(1999)與臺灣分館協議合作典藏。由臺史所將「臺灣總督府圖書館」、「南方資料館」及臺灣省圖書館購藏帝大教授藏書,運至中研院典藏、整編與開放閱覽。民國93年(2004)臺史所參與數位典藏國家型科技計畫,將前述珍貴歷史文獻史料陸續數位典藏及建置「日治時期台灣研究古籍資料庫」,並於民國94年(2005)對外開放使用。
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